Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y266

NUDC, Nuclear migration protein nudC, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCQ9Y266 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
NUDCQ9Y266 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
NUDCQ9Y266 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NUDCQ9Y266 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NUDCQ9Y266 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NUDCQ9Y266 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NUDCQ9Y266 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NUDCQ9Y266 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NUDCQ9Y266 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NUDCQ9Y266 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUDCQ9Y266 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUDCQ9Y266 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUDCQ9Y266 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
NUDCQ9Y266 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUDCQ9Y266 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUDCQ9Y266 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUDCQ9Y266 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUDCQ9Y266 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUDCQ9Y266 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUDCQ9Y266 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUDCQ9Y266 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUDCQ9Y266 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUDCQ9Y266 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUDCQ9Y266 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUDCQ9Y266 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUDCQ9Y266 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NUDCQ9Y266 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NUDCQ9Y266 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NUDCQ9Y266 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NUDCQ9Y266 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NUDCQ9Y266 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NUDCQ9Y266 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NUDCQ9Y266 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NUDCQ9Y266 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NUDCQ9Y266 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NUDCQ9Y266 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NUDCQ9Y266 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NUDCQ9Y266 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NUDCQ9Y266 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NUDCQ9Y266 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NUDCQ9Y266 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NUDCQ9Y266 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NUDCQ9Y266 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NUDCQ9Y266 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NUDCQ9Y266 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NUDCQ9Y266 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NUDCQ9Y266 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NUDCQ9Y266 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NUDCQ9Y266 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NUDCQ9Y266 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NUDCQ9Y266 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NUDCQ9Y266 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NUDCQ9Y266 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NUDCQ9Y266 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NUDCQ9Y266 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NUDCQ9Y266 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NUDCQ9Y266 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NUDCQ9Y266 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NUDCQ9Y266 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NUDCQ9Y266 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NUDCQ9Y266 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NUDCQ9Y266 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NUDCQ9Y266 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NUDCQ9Y266 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NUDCQ9Y266 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NUDCQ9Y266 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NUDCQ9Y266 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NUDCQ9Y266 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NUDCQ9Y266 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NUDCQ9Y266 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NUDCQ9Y266 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NUDCQ9Y266 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NUDCQ9Y266 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NUDCQ9Y266 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NUDCQ9Y266 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NUDCQ9Y266 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NUDCQ9Y266 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NUDCQ9Y266 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NUDCQ9Y266 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms