Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL3

CASP8AP2, CASP8-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,982 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP8AP2Q9UKL3 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CASP8AP2Q9UKL3 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASP8AP2Q9UKL3 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASP8AP2Q9UKL3 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASP8AP2Q9UKL3 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASP8AP2Q9UKL3 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASP8AP2Q9UKL3 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASP8AP2Q9UKL3 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CASP8AP2Q9UKL3 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASP8AP2Q9UKL3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASP8AP2Q9UKL3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP8AP2Q9UKL3 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP8AP2Q9UKL3 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP8AP2Q9UKL3 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP8AP2Q9UKL3 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP8AP2Q9UKL3 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP8AP2Q9UKL3 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP8AP2Q9UKL3 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP8AP2Q9UKL3 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP8AP2Q9UKL3 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP8AP2Q9UKL3 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP8AP2Q9UKL3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP8AP2Q9UKL3 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP8AP2Q9UKL3 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP8AP2Q9UKL3 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP8AP2Q9UKL3 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP8AP2Q9UKL3 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP8AP2Q9UKL3 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP8AP2Q9UKL3 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASP8AP2Q9UKL3 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CASP8AP2Q9UKL3 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASP8AP2Q9UKL3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASP8AP2Q9UKL3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASP8AP2Q9UKL3 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASP8AP2Q9UKL3 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASP8AP2Q9UKL3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASP8AP2Q9UKL3 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASP8AP2Q9UKL3 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASP8AP2Q9UKL3 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASP8AP2Q9UKL3 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASP8AP2Q9UKL3 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASP8AP2Q9UKL3 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASP8AP2Q9UKL3 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASP8AP2Q9UKL3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASP8AP2Q9UKL3 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms