Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
XCL2Q9UBD3 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms