Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTJ3

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC4Q9NTJ3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMC4Q9NTJ3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMC4Q9NTJ3 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMC4Q9NTJ3 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMC4Q9NTJ3 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMC4Q9NTJ3 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMC4Q9NTJ3 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMC4Q9NTJ3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMC4Q9NTJ3 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMC4Q9NTJ3 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMC4Q9NTJ3 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMC4Q9NTJ3 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMC4Q9NTJ3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMC4Q9NTJ3 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMC4Q9NTJ3 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMC4Q9NTJ3 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMC4Q9NTJ3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMC4Q9NTJ3 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMC4Q9NTJ3 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMC4Q9NTJ3 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMC4Q9NTJ3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMC4Q9NTJ3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMC4Q9NTJ3 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMC4Q9NTJ3 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SMC4Q9NTJ3 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMC4Q9NTJ3 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMC4Q9NTJ3 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMC4Q9NTJ3 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMC4Q9NTJ3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMC4Q9NTJ3 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMC4Q9NTJ3 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMC4Q9NTJ3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMC4Q9NTJ3 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMC4Q9NTJ3 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMC4Q9NTJ3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMC4Q9NTJ3 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMC4Q9NTJ3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMC4Q9NTJ3 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMC4Q9NTJ3 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMC4Q9NTJ3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMC4Q9NTJ3 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMC4Q9NTJ3 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMC4Q9NTJ3 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMC4Q9NTJ3 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMC4Q9NTJ3 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMC4Q9NTJ3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMC4Q9NTJ3 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMC4Q9NTJ3 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMC4Q9NTJ3 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMC4Q9NTJ3 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMC4Q9NTJ3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SMC4Q9NTJ3 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMC4Q9NTJ3 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMC4Q9NTJ3 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMC4Q9NTJ3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMC4Q9NTJ3 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMC4Q9NTJ3 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMC4Q9NTJ3 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMC4Q9NTJ3 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMC4Q9NTJ3 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMC4Q9NTJ3 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMC4Q9NTJ3 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMC4Q9NTJ3 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMC4Q9NTJ3 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMC4Q9NTJ3 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMC4Q9NTJ3 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMC4Q9NTJ3 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMC4Q9NTJ3 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMC4Q9NTJ3 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMC4Q9NTJ3 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMC4Q9NTJ3 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMC4Q9NTJ3 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMC4Q9NTJ3 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SMC4Q9NTJ3 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMC4Q9NTJ3 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMC4Q9NTJ3 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMC4Q9NTJ3 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMC4Q9NTJ3 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMC4Q9NTJ3 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms