Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI5

PDS5B, Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDS5BQ9NTI5 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
PDS5BQ9NTI5 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PDS5BQ9NTI5 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PDS5BQ9NTI5 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PDS5BQ9NTI5 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
PDS5BQ9NTI5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PDS5BQ9NTI5 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PDS5BQ9NTI5 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PDS5BQ9NTI5 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PDS5BQ9NTI5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PDS5BQ9NTI5 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PDS5BQ9NTI5 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PDS5BQ9NTI5 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PDS5BQ9NTI5 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
PDS5BQ9NTI5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PDS5BQ9NTI5 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PDS5BQ9NTI5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PDS5BQ9NTI5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PDS5BQ9NTI5 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PDS5BQ9NTI5 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PDS5BQ9NTI5 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PDS5BQ9NTI5 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
PDS5BQ9NTI5 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
PDS5BQ9NTI5 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
PDS5BQ9NTI5 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
PDS5BQ9NTI5 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PDS5BQ9NTI5 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PDS5BQ9NTI5 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
PDS5BQ9NTI5 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PDS5BQ9NTI5 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
PDS5BQ9NTI5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
PDS5BQ9NTI5 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
PDS5BQ9NTI5 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC33.59■■■□□ 2.97
PDS5BQ9NTI5 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
PDS5BQ9NTI5 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
PDS5BQ9NTI5 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
PDS5BQ9NTI5 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
PDS5BQ9NTI5 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
PDS5BQ9NTI5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
PDS5BQ9NTI5 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
PDS5BQ9NTI5 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
PDS5BQ9NTI5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
PDS5BQ9NTI5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
PDS5BQ9NTI5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
PDS5BQ9NTI5 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
PDS5BQ9NTI5 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PDS5BQ9NTI5 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
PDS5BQ9NTI5 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
PDS5BQ9NTI5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PDS5BQ9NTI5 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
PDS5BQ9NTI5 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PDS5BQ9NTI5 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PDS5BQ9NTI5 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
PDS5BQ9NTI5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
PDS5BQ9NTI5 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
PDS5BQ9NTI5 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC33.57■■■□□ 2.96
PDS5BQ9NTI5 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
PDS5BQ9NTI5 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
PDS5BQ9NTI5 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
PDS5BQ9NTI5 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
PDS5BQ9NTI5 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
PDS5BQ9NTI5 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
PDS5BQ9NTI5 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
PDS5BQ9NTI5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
PDS5BQ9NTI5 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
PDS5BQ9NTI5 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
PDS5BQ9NTI5 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
PDS5BQ9NTI5 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.56■■■□□ 2.96
PDS5BQ9NTI5 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
PDS5BQ9NTI5 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
PDS5BQ9NTI5 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
PDS5BQ9NTI5 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
PDS5BQ9NTI5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
PDS5BQ9NTI5 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
PDS5BQ9NTI5 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
PDS5BQ9NTI5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
PDS5BQ9NTI5 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
PDS5BQ9NTI5 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
PDS5BQ9NTI5 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
PDS5BQ9NTI5 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
PDS5BQ9NTI5 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
PDS5BQ9NTI5 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
PDS5BQ9NTI5 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
PDS5BQ9NTI5 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
PDS5BQ9NTI5 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
PDS5BQ9NTI5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
PDS5BQ9NTI5 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
PDS5BQ9NTI5 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
PDS5BQ9NTI5 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
PDS5BQ9NTI5 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
PDS5BQ9NTI5 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
PDS5BQ9NTI5 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
PDS5BQ9NTI5 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
PDS5BQ9NTI5 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
PDS5BQ9NTI5 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
PDS5BQ9NTI5 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
PDS5BQ9NTI5 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
PDS5BQ9NTI5 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
PDS5BQ9NTI5 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
PDS5BQ9NTI5 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms