Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU4

SMURF2, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF2, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF2Q9HAU4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SMURF2Q9HAU4 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMURF2Q9HAU4 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMURF2Q9HAU4 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMURF2Q9HAU4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMURF2Q9HAU4 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMURF2Q9HAU4 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMURF2Q9HAU4 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMURF2Q9HAU4 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMURF2Q9HAU4 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMURF2Q9HAU4 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMURF2Q9HAU4 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMURF2Q9HAU4 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMURF2Q9HAU4 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMURF2Q9HAU4 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMURF2Q9HAU4 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMURF2Q9HAU4 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMURF2Q9HAU4 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMURF2Q9HAU4 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMURF2Q9HAU4 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMURF2Q9HAU4 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMURF2Q9HAU4 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMURF2Q9HAU4 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMURF2Q9HAU4 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMURF2Q9HAU4 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMURF2Q9HAU4 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMURF2Q9HAU4 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMURF2Q9HAU4 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMURF2Q9HAU4 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMURF2Q9HAU4 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMURF2Q9HAU4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMURF2Q9HAU4 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMURF2Q9HAU4 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMURF2Q9HAU4 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMURF2Q9HAU4 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMURF2Q9HAU4 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMURF2Q9HAU4 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMURF2Q9HAU4 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMURF2Q9HAU4 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMURF2Q9HAU4 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMURF2Q9HAU4 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMURF2Q9HAU4 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMURF2Q9HAU4 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMURF2Q9HAU4 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMURF2Q9HAU4 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMURF2Q9HAU4 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMURF2Q9HAU4 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMURF2Q9HAU4 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMURF2Q9HAU4 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMURF2Q9HAU4 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMURF2Q9HAU4 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMURF2Q9HAU4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMURF2Q9HAU4 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMURF2Q9HAU4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMURF2Q9HAU4 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMURF2Q9HAU4 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMURF2Q9HAU4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SMURF2Q9HAU4 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SMURF2Q9HAU4 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMURF2Q9HAU4 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMURF2Q9HAU4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMURF2Q9HAU4 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMURF2Q9HAU4 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMURF2Q9HAU4 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMURF2Q9HAU4 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMURF2Q9HAU4 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMURF2Q9HAU4 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMURF2Q9HAU4 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMURF2Q9HAU4 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMURF2Q9HAU4 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMURF2Q9HAU4 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMURF2Q9HAU4 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMURF2Q9HAU4 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMURF2Q9HAU4 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMURF2Q9HAU4 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMURF2Q9HAU4 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMURF2Q9HAU4 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMURF2Q9HAU4 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMURF2Q9HAU4 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMURF2Q9HAU4 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMURF2Q9HAU4 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMURF2Q9HAU4 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMURF2Q9HAU4 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMURF2Q9HAU4 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMURF2Q9HAU4 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMURF2Q9HAU4 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMURF2Q9HAU4 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SMURF2Q9HAU4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMURF2Q9HAU4 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMURF2Q9HAU4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMURF2Q9HAU4 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMURF2Q9HAU4 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMURF2Q9HAU4 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMURF2Q9HAU4 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMURF2Q9HAU4 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMURF2Q9HAU4 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMURF2Q9HAU4 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMURF2Q9HAU4 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMURF2Q9HAU4 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SMURF2Q9HAU4 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms