Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W5

CCDC8, Coiled-coil domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC8Q9H0W5 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC8Q9H0W5 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms