Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms