Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE3

BARHL1, BarH-like 1 homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARHL1Q9BZE3 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BARHL1Q9BZE3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BARHL1Q9BZE3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BARHL1Q9BZE3 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BARHL1Q9BZE3 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BARHL1Q9BZE3 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BARHL1Q9BZE3 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BARHL1Q9BZE3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BARHL1Q9BZE3 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BARHL1Q9BZE3 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BARHL1Q9BZE3 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BARHL1Q9BZE3 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BARHL1Q9BZE3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BARHL1Q9BZE3 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BARHL1Q9BZE3 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BARHL1Q9BZE3 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BARHL1Q9BZE3 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BARHL1Q9BZE3 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BARHL1Q9BZE3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BARHL1Q9BZE3 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BARHL1Q9BZE3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BARHL1Q9BZE3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BARHL1Q9BZE3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BARHL1Q9BZE3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BARHL1Q9BZE3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
BARHL1Q9BZE3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BARHL1Q9BZE3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BARHL1Q9BZE3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BARHL1Q9BZE3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BARHL1Q9BZE3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
BARHL1Q9BZE3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
BARHL1Q9BZE3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
BARHL1Q9BZE3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
BARHL1Q9BZE3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
BARHL1Q9BZE3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
BARHL1Q9BZE3 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
BARHL1Q9BZE3 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BARHL1Q9BZE3 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BARHL1Q9BZE3 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BARHL1Q9BZE3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BARHL1Q9BZE3 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BARHL1Q9BZE3 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BARHL1Q9BZE3 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BARHL1Q9BZE3 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BARHL1Q9BZE3 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BARHL1Q9BZE3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BARHL1Q9BZE3 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BARHL1Q9BZE3 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BARHL1Q9BZE3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BARHL1Q9BZE3 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BARHL1Q9BZE3 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BARHL1Q9BZE3 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BARHL1Q9BZE3 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BARHL1Q9BZE3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BARHL1Q9BZE3 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BARHL1Q9BZE3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BARHL1Q9BZE3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BARHL1Q9BZE3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BARHL1Q9BZE3 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BARHL1Q9BZE3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BARHL1Q9BZE3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BARHL1Q9BZE3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BARHL1Q9BZE3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BARHL1Q9BZE3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
BARHL1Q9BZE3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BARHL1Q9BZE3 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BARHL1Q9BZE3 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BARHL1Q9BZE3 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BARHL1Q9BZE3 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BARHL1Q9BZE3 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BARHL1Q9BZE3 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BARHL1Q9BZE3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BARHL1Q9BZE3 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BARHL1Q9BZE3 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BARHL1Q9BZE3 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BARHL1Q9BZE3 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BARHL1Q9BZE3 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BARHL1Q9BZE3 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BARHL1Q9BZE3 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BARHL1Q9BZE3 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BARHL1Q9BZE3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BARHL1Q9BZE3 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BARHL1Q9BZE3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BARHL1Q9BZE3 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BARHL1Q9BZE3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BARHL1Q9BZE3 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BARHL1Q9BZE3 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BARHL1Q9BZE3 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BARHL1Q9BZE3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BARHL1Q9BZE3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BARHL1Q9BZE3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BARHL1Q9BZE3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BARHL1Q9BZE3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
BARHL1Q9BZE3 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BARHL1Q9BZE3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BARHL1Q9BZE3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
BARHL1Q9BZE3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BARHL1Q9BZE3 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BARHL1Q9BZE3 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BARHL1Q9BZE3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms