Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SCAPERQ9BY12 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SCAPERQ9BY12 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SCAPERQ9BY12 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SCAPERQ9BY12 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SCAPERQ9BY12 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SCAPERQ9BY12 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SCAPERQ9BY12 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SCAPERQ9BY12 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SCAPERQ9BY12 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SCAPERQ9BY12 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SCAPERQ9BY12 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SCAPERQ9BY12 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SCAPERQ9BY12 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
SCAPERQ9BY12 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SCAPERQ9BY12 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SCAPERQ9BY12 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SCAPERQ9BY12 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SCAPERQ9BY12 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SCAPERQ9BY12 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SCAPERQ9BY12 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SCAPERQ9BY12 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
SCAPERQ9BY12 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SCAPERQ9BY12 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
SCAPERQ9BY12 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SCAPERQ9BY12 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SCAPERQ9BY12 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SCAPERQ9BY12 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SCAPERQ9BY12 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SCAPERQ9BY12 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SCAPERQ9BY12 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SCAPERQ9BY12 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SCAPERQ9BY12 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SCAPERQ9BY12 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
SCAPERQ9BY12 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SCAPERQ9BY12 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SCAPERQ9BY12 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SCAPERQ9BY12 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SCAPERQ9BY12 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SCAPERQ9BY12 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SCAPERQ9BY12 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SCAPERQ9BY12 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SCAPERQ9BY12 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SCAPERQ9BY12 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SCAPERQ9BY12 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SCAPERQ9BY12 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SCAPERQ9BY12 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
SCAPERQ9BY12 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SCAPERQ9BY12 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SCAPERQ9BY12 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SCAPERQ9BY12 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SCAPERQ9BY12 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SCAPERQ9BY12 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SCAPERQ9BY12 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SCAPERQ9BY12 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SCAPERQ9BY12 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SCAPERQ9BY12 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SCAPERQ9BY12 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SCAPERQ9BY12 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SCAPERQ9BY12 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SCAPERQ9BY12 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SCAPERQ9BY12 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SCAPERQ9BY12 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
SCAPERQ9BY12 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SCAPERQ9BY12 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SCAPERQ9BY12 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SCAPERQ9BY12 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SCAPERQ9BY12 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SCAPERQ9BY12 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SCAPERQ9BY12 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SCAPERQ9BY12 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SCAPERQ9BY12 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SCAPERQ9BY12 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
SCAPERQ9BY12 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SCAPERQ9BY12 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SCAPERQ9BY12 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SCAPERQ9BY12 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SCAPERQ9BY12 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SCAPERQ9BY12 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SCAPERQ9BY12 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SCAPERQ9BY12 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SCAPERQ9BY12 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SCAPERQ9BY12 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
SCAPERQ9BY12 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SCAPERQ9BY12 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SCAPERQ9BY12 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SCAPERQ9BY12 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SCAPERQ9BY12 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
SCAPERQ9BY12 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SCAPERQ9BY12 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SCAPERQ9BY12 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SCAPERQ9BY12 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
SCAPERQ9BY12 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SCAPERQ9BY12 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SCAPERQ9BY12 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SCAPERQ9BY12 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SCAPERQ9BY12 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SCAPERQ9BY12 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
SCAPERQ9BY12 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
SCAPERQ9BY12 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms