Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SGIP1Q9BQI5 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SGIP1Q9BQI5 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SGIP1Q9BQI5 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SGIP1Q9BQI5 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SGIP1Q9BQI5 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SGIP1Q9BQI5 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SGIP1Q9BQI5 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SGIP1Q9BQI5 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SGIP1Q9BQI5 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SGIP1Q9BQI5 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SGIP1Q9BQI5 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SGIP1Q9BQI5 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SGIP1Q9BQI5 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SGIP1Q9BQI5 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SGIP1Q9BQI5 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SGIP1Q9BQI5 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SGIP1Q9BQI5 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SGIP1Q9BQI5 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SGIP1Q9BQI5 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SGIP1Q9BQI5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SGIP1Q9BQI5 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SGIP1Q9BQI5 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SGIP1Q9BQI5 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SGIP1Q9BQI5 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SGIP1Q9BQI5 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SGIP1Q9BQI5 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SGIP1Q9BQI5 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SGIP1Q9BQI5 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SGIP1Q9BQI5 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SGIP1Q9BQI5 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SGIP1Q9BQI5 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SGIP1Q9BQI5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SGIP1Q9BQI5 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SGIP1Q9BQI5 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SGIP1Q9BQI5 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SGIP1Q9BQI5 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SGIP1Q9BQI5 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SGIP1Q9BQI5 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SGIP1Q9BQI5 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SGIP1Q9BQI5 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SGIP1Q9BQI5 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SGIP1Q9BQI5 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SGIP1Q9BQI5 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SGIP1Q9BQI5 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SGIP1Q9BQI5 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SGIP1Q9BQI5 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SGIP1Q9BQI5 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SGIP1Q9BQI5 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SGIP1Q9BQI5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SGIP1Q9BQI5 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SGIP1Q9BQI5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SGIP1Q9BQI5 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SGIP1Q9BQI5 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SGIP1Q9BQI5 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SGIP1Q9BQI5 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SGIP1Q9BQI5 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SGIP1Q9BQI5 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SGIP1Q9BQI5 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SGIP1Q9BQI5 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SGIP1Q9BQI5 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SGIP1Q9BQI5 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SGIP1Q9BQI5 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SGIP1Q9BQI5 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SGIP1Q9BQI5 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SGIP1Q9BQI5 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SGIP1Q9BQI5 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SGIP1Q9BQI5 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SGIP1Q9BQI5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SGIP1Q9BQI5 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SGIP1Q9BQI5 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SGIP1Q9BQI5 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SGIP1Q9BQI5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SGIP1Q9BQI5 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SGIP1Q9BQI5 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SGIP1Q9BQI5 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SGIP1Q9BQI5 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SGIP1Q9BQI5 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SGIP1Q9BQI5 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SGIP1Q9BQI5 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SGIP1Q9BQI5 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SGIP1Q9BQI5 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SGIP1Q9BQI5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SGIP1Q9BQI5 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SGIP1Q9BQI5 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SGIP1Q9BQI5 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SGIP1Q9BQI5 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SGIP1Q9BQI5 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SGIP1Q9BQI5 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SGIP1Q9BQI5 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SGIP1Q9BQI5 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SGIP1Q9BQI5 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SGIP1Q9BQI5 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SGIP1Q9BQI5 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SGIP1Q9BQI5 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SGIP1Q9BQI5 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SGIP1Q9BQI5 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SGIP1Q9BQI5 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SGIP1Q9BQI5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SGIP1Q9BQI5 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms