Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW4

APOL4, Apolipoprotein L4, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL4Q9BPW4 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOL4Q9BPW4 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
APOL4Q9BPW4 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
APOL4Q9BPW4 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
APOL4Q9BPW4 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
APOL4Q9BPW4 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
APOL4Q9BPW4 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
APOL4Q9BPW4 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOL4Q9BPW4 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOL4Q9BPW4 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOL4Q9BPW4 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOL4Q9BPW4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOL4Q9BPW4 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOL4Q9BPW4 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOL4Q9BPW4 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOL4Q9BPW4 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOL4Q9BPW4 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOL4Q9BPW4 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOL4Q9BPW4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOL4Q9BPW4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOL4Q9BPW4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOL4Q9BPW4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
APOL4Q9BPW4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms