Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY5

CRAMP1, Protein cramped-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRAMP1Q96RY5 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CRAMP1Q96RY5 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms