Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC17Q96LX7 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC17Q96LX7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC17Q96LX7 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC17Q96LX7 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC17Q96LX7 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC17Q96LX7 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms