Protein–RNA interactions for Protein: Q96JW4

SLC41A2, Solute carrier family 41 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC41A2Q96JW4 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC41A2Q96JW4 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC41A2Q96JW4 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC41A2Q96JW4 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC41A2Q96JW4 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC41A2Q96JW4 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC41A2Q96JW4 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC41A2Q96JW4 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC41A2Q96JW4 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC41A2Q96JW4 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC41A2Q96JW4 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC41A2Q96JW4 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC41A2Q96JW4 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC41A2Q96JW4 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC41A2Q96JW4 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC41A2Q96JW4 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC41A2Q96JW4 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC41A2Q96JW4 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC41A2Q96JW4 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC41A2Q96JW4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC41A2Q96JW4 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC41A2Q96JW4 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC41A2Q96JW4 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC41A2Q96JW4 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC41A2Q96JW4 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC41A2Q96JW4 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC41A2Q96JW4 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC41A2Q96JW4 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC41A2Q96JW4 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC41A2Q96JW4 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC41A2Q96JW4 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC41A2Q96JW4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC41A2Q96JW4 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC41A2Q96JW4 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC41A2Q96JW4 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC41A2Q96JW4 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC41A2Q96JW4 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC41A2Q96JW4 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC41A2Q96JW4 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC41A2Q96JW4 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC41A2Q96JW4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC41A2Q96JW4 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC41A2Q96JW4 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC41A2Q96JW4 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC41A2Q96JW4 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC41A2Q96JW4 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC41A2Q96JW4 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC41A2Q96JW4 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC41A2Q96JW4 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC41A2Q96JW4 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC41A2Q96JW4 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC41A2Q96JW4 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC41A2Q96JW4 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC41A2Q96JW4 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC41A2Q96JW4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC41A2Q96JW4 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC41A2Q96JW4 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC41A2Q96JW4 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC41A2Q96JW4 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC41A2Q96JW4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC41A2Q96JW4 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC41A2Q96JW4 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC41A2Q96JW4 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC41A2Q96JW4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC41A2Q96JW4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC41A2Q96JW4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC41A2Q96JW4 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC41A2Q96JW4 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC41A2Q96JW4 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC41A2Q96JW4 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC41A2Q96JW4 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC41A2Q96JW4 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC41A2Q96JW4 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC41A2Q96JW4 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC41A2Q96JW4 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC41A2Q96JW4 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC41A2Q96JW4 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC41A2Q96JW4 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC41A2Q96JW4 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC41A2Q96JW4 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC41A2Q96JW4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC41A2Q96JW4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC41A2Q96JW4 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC41A2Q96JW4 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC41A2Q96JW4 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC41A2Q96JW4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC41A2Q96JW4 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC41A2Q96JW4 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC41A2Q96JW4 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC41A2Q96JW4 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC41A2Q96JW4 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC41A2Q96JW4 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC41A2Q96JW4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC41A2Q96JW4 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC41A2Q96JW4 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC41A2Q96JW4 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC41A2Q96JW4 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC41A2Q96JW4 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC41A2Q96JW4 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC41A2Q96JW4 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms