Protein–RNA interactions for Protein: Q96JH7

VCPIP1, Deubiquitinating protein VCIP135, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPIP1Q96JH7 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms