Protein–RNA interactions for Protein: Q96GE6

CALML4, Calmodulin-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALML4Q96GE6 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALML4Q96GE6 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALML4Q96GE6 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALML4Q96GE6 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALML4Q96GE6 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALML4Q96GE6 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALML4Q96GE6 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALML4Q96GE6 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALML4Q96GE6 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALML4Q96GE6 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALML4Q96GE6 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALML4Q96GE6 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALML4Q96GE6 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALML4Q96GE6 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALML4Q96GE6 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALML4Q96GE6 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALML4Q96GE6 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALML4Q96GE6 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALML4Q96GE6 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALML4Q96GE6 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALML4Q96GE6 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALML4Q96GE6 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CALML4Q96GE6 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CALML4Q96GE6 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CALML4Q96GE6 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CALML4Q96GE6 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CALML4Q96GE6 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22■■□□□ 1.11
CALML4Q96GE6 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CALML4Q96GE6 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CALML4Q96GE6 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CALML4Q96GE6 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CALML4Q96GE6 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CALML4Q96GE6 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CALML4Q96GE6 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CALML4Q96GE6 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CALML4Q96GE6 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CALML4Q96GE6 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CALML4Q96GE6 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CALML4Q96GE6 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CALML4Q96GE6 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CALML4Q96GE6 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CALML4Q96GE6 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CALML4Q96GE6 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CALML4Q96GE6 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CALML4Q96GE6 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CALML4Q96GE6 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CALML4Q96GE6 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CALML4Q96GE6 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CALML4Q96GE6 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CALML4Q96GE6 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CALML4Q96GE6 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CALML4Q96GE6 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CALML4Q96GE6 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CALML4Q96GE6 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CALML4Q96GE6 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CALML4Q96GE6 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CALML4Q96GE6 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CALML4Q96GE6 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CALML4Q96GE6 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CALML4Q96GE6 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CALML4Q96GE6 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CALML4Q96GE6 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CALML4Q96GE6 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CALML4Q96GE6 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms