Protein–RNA interactions for Protein: Q969V6

MKL1, MKL/myocardin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKL1Q969V6 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MKL1Q969V6 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MKL1Q969V6 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MKL1Q969V6 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MKL1Q969V6 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MKL1Q969V6 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MKL1Q969V6 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MKL1Q969V6 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MKL1Q969V6 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MKL1Q969V6 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MKL1Q969V6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MKL1Q969V6 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MKL1Q969V6 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MKL1Q969V6 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MKL1Q969V6 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MKL1Q969V6 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MKL1Q969V6 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MKL1Q969V6 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MKL1Q969V6 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MKL1Q969V6 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MKL1Q969V6 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MKL1Q969V6 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MKL1Q969V6 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MKL1Q969V6 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MKL1Q969V6 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MKL1Q969V6 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MKL1Q969V6 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MKL1Q969V6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MKL1Q969V6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MKL1Q969V6 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MKL1Q969V6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MKL1Q969V6 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MKL1Q969V6 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MKL1Q969V6 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MKL1Q969V6 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MKL1Q969V6 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MKL1Q969V6 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MKL1Q969V6 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MKL1Q969V6 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MKL1Q969V6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MKL1Q969V6 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MKL1Q969V6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MKL1Q969V6 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MKL1Q969V6 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MKL1Q969V6 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MKL1Q969V6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MKL1Q969V6 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MKL1Q969V6 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MKL1Q969V6 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MKL1Q969V6 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MKL1Q969V6 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MKL1Q969V6 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MKL1Q969V6 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MKL1Q969V6 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MKL1Q969V6 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MKL1Q969V6 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MKL1Q969V6 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MKL1Q969V6 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MKL1Q969V6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MKL1Q969V6 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MKL1Q969V6 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MKL1Q969V6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MKL1Q969V6 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MKL1Q969V6 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MKL1Q969V6 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MKL1Q969V6 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MKL1Q969V6 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MKL1Q969V6 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MKL1Q969V6 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MKL1Q969V6 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MKL1Q969V6 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MKL1Q969V6 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MKL1Q969V6 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MKL1Q969V6 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MKL1Q969V6 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MKL1Q969V6 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MKL1Q969V6 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MKL1Q969V6 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MKL1Q969V6 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MKL1Q969V6 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MKL1Q969V6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MKL1Q969V6 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MKL1Q969V6 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MKL1Q969V6 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MKL1Q969V6 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MKL1Q969V6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MKL1Q969V6 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MKL1Q969V6 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MKL1Q969V6 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MKL1Q969V6 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MKL1Q969V6 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MKL1Q969V6 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MKL1Q969V6 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MKL1Q969V6 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MKL1Q969V6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MKL1Q969V6 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MKL1Q969V6 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MKL1Q969V6 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MKL1Q969V6 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MKL1Q969V6 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms