Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms