Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1G2

CMTR1, Cap-specific mRNA (nucleoside-2'-O-)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTR1Q8N1G2 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CMTR1Q8N1G2 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CMTR1Q8N1G2 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CMTR1Q8N1G2 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CMTR1Q8N1G2 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CMTR1Q8N1G2 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CMTR1Q8N1G2 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CMTR1Q8N1G2 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CMTR1Q8N1G2 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CMTR1Q8N1G2 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CMTR1Q8N1G2 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CMTR1Q8N1G2 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CMTR1Q8N1G2 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CMTR1Q8N1G2 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CMTR1Q8N1G2 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CMTR1Q8N1G2 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CMTR1Q8N1G2 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CMTR1Q8N1G2 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CMTR1Q8N1G2 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CMTR1Q8N1G2 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CMTR1Q8N1G2 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CMTR1Q8N1G2 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CMTR1Q8N1G2 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CMTR1Q8N1G2 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CMTR1Q8N1G2 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CMTR1Q8N1G2 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CMTR1Q8N1G2 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CMTR1Q8N1G2 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CMTR1Q8N1G2 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CMTR1Q8N1G2 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CMTR1Q8N1G2 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CMTR1Q8N1G2 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CMTR1Q8N1G2 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CMTR1Q8N1G2 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms