Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LMNTD2Q8IXW0 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LMNTD2Q8IXW0 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LMNTD2Q8IXW0 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LMNTD2Q8IXW0 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LMNTD2Q8IXW0 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
LMNTD2Q8IXW0 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LMNTD2Q8IXW0 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LMNTD2Q8IXW0 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LMNTD2Q8IXW0 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LMNTD2Q8IXW0 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
LMNTD2Q8IXW0 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LMNTD2Q8IXW0 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LMNTD2Q8IXW0 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LMNTD2Q8IXW0 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LMNTD2Q8IXW0 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LMNTD2Q8IXW0 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
LMNTD2Q8IXW0 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LMNTD2Q8IXW0 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LMNTD2Q8IXW0 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LMNTD2Q8IXW0 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LMNTD2Q8IXW0 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LMNTD2Q8IXW0 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LMNTD2Q8IXW0 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LMNTD2Q8IXW0 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LMNTD2Q8IXW0 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LMNTD2Q8IXW0 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
LMNTD2Q8IXW0 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LMNTD2Q8IXW0 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LMNTD2Q8IXW0 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LMNTD2Q8IXW0 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LMNTD2Q8IXW0 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LMNTD2Q8IXW0 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LMNTD2Q8IXW0 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LMNTD2Q8IXW0 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LMNTD2Q8IXW0 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LMNTD2Q8IXW0 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LMNTD2Q8IXW0 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LMNTD2Q8IXW0 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LMNTD2Q8IXW0 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
LMNTD2Q8IXW0 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LMNTD2Q8IXW0 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LMNTD2Q8IXW0 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LMNTD2Q8IXW0 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LMNTD2Q8IXW0 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms