Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA2D4Q7Z3S7 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms