Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3J3

RGPD4, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD4Q7Z3J3 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RGPD4Q7Z3J3 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RGPD4Q7Z3J3 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RGPD4Q7Z3J3 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RGPD4Q7Z3J3 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RGPD4Q7Z3J3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RGPD4Q7Z3J3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RGPD4Q7Z3J3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RGPD4Q7Z3J3 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RGPD4Q7Z3J3 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RGPD4Q7Z3J3 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RGPD4Q7Z3J3 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RGPD4Q7Z3J3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RGPD4Q7Z3J3 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RGPD4Q7Z3J3 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RGPD4Q7Z3J3 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RGPD4Q7Z3J3 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RGPD4Q7Z3J3 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RGPD4Q7Z3J3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RGPD4Q7Z3J3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RGPD4Q7Z3J3 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RGPD4Q7Z3J3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RGPD4Q7Z3J3 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RGPD4Q7Z3J3 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RGPD4Q7Z3J3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RGPD4Q7Z3J3 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RGPD4Q7Z3J3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RGPD4Q7Z3J3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RGPD4Q7Z3J3 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RGPD4Q7Z3J3 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RGPD4Q7Z3J3 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RGPD4Q7Z3J3 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RGPD4Q7Z3J3 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RGPD4Q7Z3J3 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RGPD4Q7Z3J3 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RGPD4Q7Z3J3 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RGPD4Q7Z3J3 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RGPD4Q7Z3J3 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RGPD4Q7Z3J3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RGPD4Q7Z3J3 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RGPD4Q7Z3J3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RGPD4Q7Z3J3 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RGPD4Q7Z3J3 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RGPD4Q7Z3J3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RGPD4Q7Z3J3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RGPD4Q7Z3J3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RGPD4Q7Z3J3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RGPD4Q7Z3J3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RGPD4Q7Z3J3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RGPD4Q7Z3J3 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RGPD4Q7Z3J3 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
RGPD4Q7Z3J3 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RGPD4Q7Z3J3 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RGPD4Q7Z3J3 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
RGPD4Q7Z3J3 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RGPD4Q7Z3J3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RGPD4Q7Z3J3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RGPD4Q7Z3J3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RGPD4Q7Z3J3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RGPD4Q7Z3J3 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RGPD4Q7Z3J3 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RGPD4Q7Z3J3 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RGPD4Q7Z3J3 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RGPD4Q7Z3J3 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RGPD4Q7Z3J3 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RGPD4Q7Z3J3 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RGPD4Q7Z3J3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RGPD4Q7Z3J3 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RGPD4Q7Z3J3 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RGPD4Q7Z3J3 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RGPD4Q7Z3J3 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RGPD4Q7Z3J3 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RGPD4Q7Z3J3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RGPD4Q7Z3J3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RGPD4Q7Z3J3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RGPD4Q7Z3J3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RGPD4Q7Z3J3 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RGPD4Q7Z3J3 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RGPD4Q7Z3J3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RGPD4Q7Z3J3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RGPD4Q7Z3J3 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RGPD4Q7Z3J3 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RGPD4Q7Z3J3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RGPD4Q7Z3J3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RGPD4Q7Z3J3 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RGPD4Q7Z3J3 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RGPD4Q7Z3J3 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RGPD4Q7Z3J3 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RGPD4Q7Z3J3 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RGPD4Q7Z3J3 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RGPD4Q7Z3J3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RGPD4Q7Z3J3 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RGPD4Q7Z3J3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RGPD4Q7Z3J3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RGPD4Q7Z3J3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RGPD4Q7Z3J3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RGPD4Q7Z3J3 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RGPD4Q7Z3J3 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RGPD4Q7Z3J3 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RGPD4Q7Z3J3 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms