Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z398

ZNF550, Zinc finger protein 550, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF550Q7Z398 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF550Q7Z398 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF550Q7Z398 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF550Q7Z398 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF550Q7Z398 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF550Q7Z398 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF550Q7Z398 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF550Q7Z398 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF550Q7Z398 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF550Q7Z398 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF550Q7Z398 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF550Q7Z398 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF550Q7Z398 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF550Q7Z398 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF550Q7Z398 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF550Q7Z398 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF550Q7Z398 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF550Q7Z398 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF550Q7Z398 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF550Q7Z398 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF550Q7Z398 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF550Q7Z398 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF550Q7Z398 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF550Q7Z398 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF550Q7Z398 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF550Q7Z398 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF550Q7Z398 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF550Q7Z398 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF550Q7Z398 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF550Q7Z398 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF550Q7Z398 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF550Q7Z398 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF550Q7Z398 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF550Q7Z398 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF550Q7Z398 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF550Q7Z398 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF550Q7Z398 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF550Q7Z398 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF550Q7Z398 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF550Q7Z398 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF550Q7Z398 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF550Q7Z398 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF550Q7Z398 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF550Q7Z398 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF550Q7Z398 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF550Q7Z398 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF550Q7Z398 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF550Q7Z398 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF550Q7Z398 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF550Q7Z398 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF550Q7Z398 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF550Q7Z398 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF550Q7Z398 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF550Q7Z398 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF550Q7Z398 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF550Q7Z398 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF550Q7Z398 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF550Q7Z398 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF550Q7Z398 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF550Q7Z398 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF550Q7Z398 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF550Q7Z398 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF550Q7Z398 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF550Q7Z398 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF550Q7Z398 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF550Q7Z398 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF550Q7Z398 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF550Q7Z398 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ZNF550Q7Z398 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF550Q7Z398 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF550Q7Z398 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF550Q7Z398 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF550Q7Z398 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF550Q7Z398 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF550Q7Z398 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF550Q7Z398 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF550Q7Z398 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF550Q7Z398 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF550Q7Z398 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF550Q7Z398 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF550Q7Z398 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF550Q7Z398 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF550Q7Z398 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF550Q7Z398 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF550Q7Z398 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ZNF550Q7Z398 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF550Q7Z398 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF550Q7Z398 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF550Q7Z398 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF550Q7Z398 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF550Q7Z398 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF550Q7Z398 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF550Q7Z398 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF550Q7Z398 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF550Q7Z398 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF550Q7Z398 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF550Q7Z398 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF550Q7Z398 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF550Q7Z398 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF550Q7Z398 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms