Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TCF23Q7RTU1 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TCF23Q7RTU1 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TCF23Q7RTU1 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TCF23Q7RTU1 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TCF23Q7RTU1 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TCF23Q7RTU1 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TCF23Q7RTU1 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TCF23Q7RTU1 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TCF23Q7RTU1 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TCF23Q7RTU1 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TCF23Q7RTU1 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TCF23Q7RTU1 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TCF23Q7RTU1 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TCF23Q7RTU1 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TCF23Q7RTU1 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TCF23Q7RTU1 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TCF23Q7RTU1 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TCF23Q7RTU1 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TCF23Q7RTU1 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TCF23Q7RTU1 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TCF23Q7RTU1 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TCF23Q7RTU1 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TCF23Q7RTU1 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TCF23Q7RTU1 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TCF23Q7RTU1 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TCF23Q7RTU1 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TCF23Q7RTU1 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TCF23Q7RTU1 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TCF23Q7RTU1 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TCF23Q7RTU1 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TCF23Q7RTU1 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TCF23Q7RTU1 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TCF23Q7RTU1 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TCF23Q7RTU1 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TCF23Q7RTU1 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TCF23Q7RTU1 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TCF23Q7RTU1 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TCF23Q7RTU1 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TCF23Q7RTU1 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TCF23Q7RTU1 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TCF23Q7RTU1 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TCF23Q7RTU1 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TCF23Q7RTU1 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TCF23Q7RTU1 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TCF23Q7RTU1 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TCF23Q7RTU1 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TCF23Q7RTU1 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TCF23Q7RTU1 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TCF23Q7RTU1 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TCF23Q7RTU1 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TCF23Q7RTU1 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TCF23Q7RTU1 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TCF23Q7RTU1 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TCF23Q7RTU1 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TCF23Q7RTU1 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TCF23Q7RTU1 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TCF23Q7RTU1 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TCF23Q7RTU1 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TCF23Q7RTU1 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TCF23Q7RTU1 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TCF23Q7RTU1 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TCF23Q7RTU1 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TCF23Q7RTU1 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TCF23Q7RTU1 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TCF23Q7RTU1 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TCF23Q7RTU1 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TCF23Q7RTU1 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TCF23Q7RTU1 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms