Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

Predictions only

Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
USP31Q70CQ4 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
USP31Q70CQ4 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
USP31Q70CQ4 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
USP31Q70CQ4 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
USP31Q70CQ4 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
USP31Q70CQ4 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
USP31Q70CQ4 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
USP31Q70CQ4 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
USP31Q70CQ4 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
USP31Q70CQ4 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
USP31Q70CQ4 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
USP31Q70CQ4 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
USP31Q70CQ4 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
USP31Q70CQ4 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
USP31Q70CQ4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
USP31Q70CQ4 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
USP31Q70CQ4 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
USP31Q70CQ4 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
USP31Q70CQ4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
USP31Q70CQ4 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
USP31Q70CQ4 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
USP31Q70CQ4 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
USP31Q70CQ4 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
USP31Q70CQ4 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
USP31Q70CQ4 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
USP31Q70CQ4 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
USP31Q70CQ4 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
USP31Q70CQ4 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
USP31Q70CQ4 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
USP31Q70CQ4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
USP31Q70CQ4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
USP31Q70CQ4 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
USP31Q70CQ4 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
USP31Q70CQ4 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
USP31Q70CQ4 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
USP31Q70CQ4 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
USP31Q70CQ4 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
USP31Q70CQ4 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
USP31Q70CQ4 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
USP31Q70CQ4 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
USP31Q70CQ4 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
USP31Q70CQ4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
USP31Q70CQ4 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
USP31Q70CQ4 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
USP31Q70CQ4 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
USP31Q70CQ4 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
USP31Q70CQ4 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.8
USP31Q70CQ4 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
USP31Q70CQ4 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
USP31Q70CQ4 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
USP31Q70CQ4 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
USP31Q70CQ4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
USP31Q70CQ4 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
USP31Q70CQ4 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
USP31Q70CQ4 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
USP31Q70CQ4 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
USP31Q70CQ4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
USP31Q70CQ4 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
USP31Q70CQ4 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
USP31Q70CQ4 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
USP31Q70CQ4 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
USP31Q70CQ4 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
USP31Q70CQ4 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
USP31Q70CQ4 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
USP31Q70CQ4 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
USP31Q70CQ4 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
USP31Q70CQ4 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
USP31Q70CQ4 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
USP31Q70CQ4 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
USP31Q70CQ4 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
USP31Q70CQ4 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
USP31Q70CQ4 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
USP31Q70CQ4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
USP31Q70CQ4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
USP31Q70CQ4 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
USP31Q70CQ4 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
USP31Q70CQ4 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
USP31Q70CQ4 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
USP31Q70CQ4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
USP31Q70CQ4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
USP31Q70CQ4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
USP31Q70CQ4 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
USP31Q70CQ4 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
USP31Q70CQ4 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
USP31Q70CQ4 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
USP31Q70CQ4 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
USP31Q70CQ4 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
USP31Q70CQ4 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
USP31Q70CQ4 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
USP31Q70CQ4 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
USP31Q70CQ4 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
USP31Q70CQ4 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
USP31Q70CQ4 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
USP31Q70CQ4 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
USP31Q70CQ4 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
USP31Q70CQ4 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
USP31Q70CQ4 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
USP31Q70CQ4 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
USP31Q70CQ4 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
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