Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV73

FGD6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD6Q6ZV73 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
FGD6Q6ZV73 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
FGD6Q6ZV73 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
FGD6Q6ZV73 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
FGD6Q6ZV73 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
FGD6Q6ZV73 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
FGD6Q6ZV73 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
FGD6Q6ZV73 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
FGD6Q6ZV73 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
FGD6Q6ZV73 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
FGD6Q6ZV73 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
FGD6Q6ZV73 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
FGD6Q6ZV73 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
FGD6Q6ZV73 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
FGD6Q6ZV73 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
FGD6Q6ZV73 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
FGD6Q6ZV73 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
FGD6Q6ZV73 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
FGD6Q6ZV73 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
FGD6Q6ZV73 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
FGD6Q6ZV73 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
FGD6Q6ZV73 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
FGD6Q6ZV73 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
FGD6Q6ZV73 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
FGD6Q6ZV73 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
FGD6Q6ZV73 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
FGD6Q6ZV73 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
FGD6Q6ZV73 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
FGD6Q6ZV73 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
FGD6Q6ZV73 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
FGD6Q6ZV73 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
FGD6Q6ZV73 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
FGD6Q6ZV73 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
FGD6Q6ZV73 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
FGD6Q6ZV73 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
FGD6Q6ZV73 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
FGD6Q6ZV73 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
FGD6Q6ZV73 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
FGD6Q6ZV73 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
FGD6Q6ZV73 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
FGD6Q6ZV73 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
FGD6Q6ZV73 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
FGD6Q6ZV73 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
FGD6Q6ZV73 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
FGD6Q6ZV73 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
FGD6Q6ZV73 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
FGD6Q6ZV73 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC29.66■■■□□ 2.34
FGD6Q6ZV73 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
FGD6Q6ZV73 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
FGD6Q6ZV73 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
FGD6Q6ZV73 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
FGD6Q6ZV73 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
FGD6Q6ZV73 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
FGD6Q6ZV73 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
FGD6Q6ZV73 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
FGD6Q6ZV73 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
FGD6Q6ZV73 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
FGD6Q6ZV73 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
FGD6Q6ZV73 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
FGD6Q6ZV73 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
FGD6Q6ZV73 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
FGD6Q6ZV73 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
FGD6Q6ZV73 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
FGD6Q6ZV73 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
FGD6Q6ZV73 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
FGD6Q6ZV73 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
FGD6Q6ZV73 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
FGD6Q6ZV73 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
FGD6Q6ZV73 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
FGD6Q6ZV73 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
FGD6Q6ZV73 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
FGD6Q6ZV73 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
FGD6Q6ZV73 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
FGD6Q6ZV73 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
FGD6Q6ZV73 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
FGD6Q6ZV73 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
FGD6Q6ZV73 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
FGD6Q6ZV73 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
FGD6Q6ZV73 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
FGD6Q6ZV73 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
FGD6Q6ZV73 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
FGD6Q6ZV73 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
FGD6Q6ZV73 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
FGD6Q6ZV73 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
FGD6Q6ZV73 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
FGD6Q6ZV73 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
FGD6Q6ZV73 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
FGD6Q6ZV73 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
FGD6Q6ZV73 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
FGD6Q6ZV73 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
FGD6Q6ZV73 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
FGD6Q6ZV73 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
FGD6Q6ZV73 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
FGD6Q6ZV73 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
FGD6Q6ZV73 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
FGD6Q6ZV73 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
FGD6Q6ZV73 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
FGD6Q6ZV73 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
FGD6Q6ZV73 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
FGD6Q6ZV73 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms