Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
LRRC9Q6ZRR7 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
LRRC9Q6ZRR7 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
LRRC9Q6ZRR7 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
LRRC9Q6ZRR7 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
LRRC9Q6ZRR7 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
LRRC9Q6ZRR7 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
LRRC9Q6ZRR7 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
LRRC9Q6ZRR7 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
LRRC9Q6ZRR7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
LRRC9Q6ZRR7 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
LRRC9Q6ZRR7 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
LRRC9Q6ZRR7 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
LRRC9Q6ZRR7 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
LRRC9Q6ZRR7 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
LRRC9Q6ZRR7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
LRRC9Q6ZRR7 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
LRRC9Q6ZRR7 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
LRRC9Q6ZRR7 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
LRRC9Q6ZRR7 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
LRRC9Q6ZRR7 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
LRRC9Q6ZRR7 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
LRRC9Q6ZRR7 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
LRRC9Q6ZRR7 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
LRRC9Q6ZRR7 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
LRRC9Q6ZRR7 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
LRRC9Q6ZRR7 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
LRRC9Q6ZRR7 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
LRRC9Q6ZRR7 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
LRRC9Q6ZRR7 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
LRRC9Q6ZRR7 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
LRRC9Q6ZRR7 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
LRRC9Q6ZRR7 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
LRRC9Q6ZRR7 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
LRRC9Q6ZRR7 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
LRRC9Q6ZRR7 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
LRRC9Q6ZRR7 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
LRRC9Q6ZRR7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
LRRC9Q6ZRR7 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
LRRC9Q6ZRR7 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
LRRC9Q6ZRR7 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
LRRC9Q6ZRR7 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
LRRC9Q6ZRR7 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
LRRC9Q6ZRR7 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
LRRC9Q6ZRR7 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
LRRC9Q6ZRR7 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
LRRC9Q6ZRR7 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
LRRC9Q6ZRR7 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
LRRC9Q6ZRR7 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
LRRC9Q6ZRR7 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
LRRC9Q6ZRR7 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
LRRC9Q6ZRR7 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
LRRC9Q6ZRR7 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
LRRC9Q6ZRR7 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
LRRC9Q6ZRR7 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
LRRC9Q6ZRR7 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
LRRC9Q6ZRR7 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
LRRC9Q6ZRR7 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
LRRC9Q6ZRR7 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
LRRC9Q6ZRR7 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
LRRC9Q6ZRR7 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
LRRC9Q6ZRR7 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
LRRC9Q6ZRR7 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
LRRC9Q6ZRR7 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
LRRC9Q6ZRR7 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
LRRC9Q6ZRR7 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
LRRC9Q6ZRR7 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
LRRC9Q6ZRR7 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
LRRC9Q6ZRR7 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
LRRC9Q6ZRR7 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC30.12■■■□□ 2.41
LRRC9Q6ZRR7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
LRRC9Q6ZRR7 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
LRRC9Q6ZRR7 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
LRRC9Q6ZRR7 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
LRRC9Q6ZRR7 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
LRRC9Q6ZRR7 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
LRRC9Q6ZRR7 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
LRRC9Q6ZRR7 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
LRRC9Q6ZRR7 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
LRRC9Q6ZRR7 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
LRRC9Q6ZRR7 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
LRRC9Q6ZRR7 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
LRRC9Q6ZRR7 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
LRRC9Q6ZRR7 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
LRRC9Q6ZRR7 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
LRRC9Q6ZRR7 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
LRRC9Q6ZRR7 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
LRRC9Q6ZRR7 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
LRRC9Q6ZRR7 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
LRRC9Q6ZRR7 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
LRRC9Q6ZRR7 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
LRRC9Q6ZRR7 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
LRRC9Q6ZRR7 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
LRRC9Q6ZRR7 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
LRRC9Q6ZRR7 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
LRRC9Q6ZRR7 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
LRRC9Q6ZRR7 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
LRRC9Q6ZRR7 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
LRRC9Q6ZRR7 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
LRRC9Q6ZRR7 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms