Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms