Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 NUP58-203ENST00000381747 1659 ntTSL 515.19■□□□□ 0.023e-9■■■■■ 36.4
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PRPF8Q6P2Q9 POLA1-201ENST00000379059 5440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.513e-7■■■■■ 36.3
PRPF8Q6P2Q9 POLA1-206ENST00000611764 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.513e-7■■■■■ 36.3
PRPF8Q6P2Q9 NIT2-201ENST00000394140 7289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.567e-9■■■■■ 36.3
PRPF8Q6P2Q9 PFKFB4-210ENST00000468162 576 ntTSL 54.32□□□□□ -1.722e-16■■■■■ 36.3
PRPF8Q6P2Q9 NIT2-206ENST00000480073 625 ntTSL 32.92□□□□□ -1.947e-9■■■■■ 36.3
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PRPF8Q6P2Q9 DAPK1-205ENST00000468482 487 ntTSL 210.67□□□□□ -0.79e-7■■■■■ 36.2
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PRPF8Q6P2Q9 POLE-219ENST00000544414 575 ntTSL 216.29■□□□□ 0.29e-12■■■■■ 36.2
PRPF8Q6P2Q9 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.124e-6■■■■■ 36.2
PRPF8Q6P2Q9 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.121e-6■■■■■ 36.2
PRPF8Q6P2Q9 ZNFX1-204ENST00000396105 7371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.121e-6■■■■■ 36.2
PRPF8Q6P2Q9 ZNFX1-202ENST00000371752 7212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.421e-6■■■■■ 36.2
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