Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
APOBEC3HQ6NTF7 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOBEC3HQ6NTF7 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOBEC3HQ6NTF7 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
APOBEC3HQ6NTF7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOBEC3HQ6NTF7 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOBEC3HQ6NTF7 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOBEC3HQ6NTF7 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOBEC3HQ6NTF7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOBEC3HQ6NTF7 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOBEC3HQ6NTF7 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOBEC3HQ6NTF7 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOBEC3HQ6NTF7 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
APOBEC3HQ6NTF7 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOBEC3HQ6NTF7 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOBEC3HQ6NTF7 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
APOBEC3HQ6NTF7 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOBEC3HQ6NTF7 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOBEC3HQ6NTF7 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
APOBEC3HQ6NTF7 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOBEC3HQ6NTF7 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOBEC3HQ6NTF7 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOBEC3HQ6NTF7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOBEC3HQ6NTF7 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOBEC3HQ6NTF7 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOBEC3HQ6NTF7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOBEC3HQ6NTF7 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOBEC3HQ6NTF7 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOBEC3HQ6NTF7 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOBEC3HQ6NTF7 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
APOBEC3HQ6NTF7 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOBEC3HQ6NTF7 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOBEC3HQ6NTF7 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOBEC3HQ6NTF7 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOBEC3HQ6NTF7 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOBEC3HQ6NTF7 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
APOBEC3HQ6NTF7 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
APOBEC3HQ6NTF7 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOBEC3HQ6NTF7 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOBEC3HQ6NTF7 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOBEC3HQ6NTF7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
APOBEC3HQ6NTF7 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
APOBEC3HQ6NTF7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOBEC3HQ6NTF7 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
APOBEC3HQ6NTF7 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOBEC3HQ6NTF7 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOBEC3HQ6NTF7 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOBEC3HQ6NTF7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOBEC3HQ6NTF7 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOBEC3HQ6NTF7 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
APOBEC3HQ6NTF7 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOBEC3HQ6NTF7 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOBEC3HQ6NTF7 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOBEC3HQ6NTF7 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOBEC3HQ6NTF7 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOBEC3HQ6NTF7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOBEC3HQ6NTF7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOBEC3HQ6NTF7 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOBEC3HQ6NTF7 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOBEC3HQ6NTF7 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
APOBEC3HQ6NTF7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOBEC3HQ6NTF7 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOBEC3HQ6NTF7 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOBEC3HQ6NTF7 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
APOBEC3HQ6NTF7 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOBEC3HQ6NTF7 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOBEC3HQ6NTF7 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOBEC3HQ6NTF7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOBEC3HQ6NTF7 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOBEC3HQ6NTF7 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOBEC3HQ6NTF7 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOBEC3HQ6NTF7 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOBEC3HQ6NTF7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOBEC3HQ6NTF7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOBEC3HQ6NTF7 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
APOBEC3HQ6NTF7 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOBEC3HQ6NTF7 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOBEC3HQ6NTF7 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOBEC3HQ6NTF7 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOBEC3HQ6NTF7 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOBEC3HQ6NTF7 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOBEC3HQ6NTF7 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
APOBEC3HQ6NTF7 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOBEC3HQ6NTF7 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOBEC3HQ6NTF7 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOBEC3HQ6NTF7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOBEC3HQ6NTF7 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOBEC3HQ6NTF7 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOBEC3HQ6NTF7 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOBEC3HQ6NTF7 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOBEC3HQ6NTF7 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOBEC3HQ6NTF7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOBEC3HQ6NTF7 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOBEC3HQ6NTF7 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOBEC3HQ6NTF7 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
APOBEC3HQ6NTF7 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOBEC3HQ6NTF7 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
APOBEC3HQ6NTF7 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms