Protein–RNA interactions for Protein: Q6IBW4

NCAPH2, Condensin-2 complex subunit H2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPH2Q6IBW4 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms