Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0T0

MARCH8, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH8, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH8Q5T0T0 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MARCH8Q5T0T0 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MARCH8Q5T0T0 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MARCH8Q5T0T0 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MARCH8Q5T0T0 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
MARCH8Q5T0T0 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MARCH8Q5T0T0 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MARCH8Q5T0T0 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MARCH8Q5T0T0 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
MARCH8Q5T0T0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms