Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TDRD12Q587J7 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms