Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms