Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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TNXAQ16473 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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TNXAQ16473 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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TNXAQ16473 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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TNXAQ16473 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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TNXAQ16473 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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TNXAQ16473 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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TNXAQ16473 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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TNXAQ16473 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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TNXAQ16473 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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