Protein–RNA interactions for Protein: Q16134

ETFDH, Electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFDHQ16134 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ETFDHQ16134 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ETFDHQ16134 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ETFDHQ16134 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ETFDHQ16134 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ETFDHQ16134 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ETFDHQ16134 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ETFDHQ16134 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ETFDHQ16134 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ETFDHQ16134 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ETFDHQ16134 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ETFDHQ16134 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ETFDHQ16134 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ETFDHQ16134 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ETFDHQ16134 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ETFDHQ16134 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ETFDHQ16134 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ETFDHQ16134 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ETFDHQ16134 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ETFDHQ16134 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ETFDHQ16134 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ETFDHQ16134 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ETFDHQ16134 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ETFDHQ16134 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ETFDHQ16134 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ETFDHQ16134 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ETFDHQ16134 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ETFDHQ16134 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ETFDHQ16134 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ETFDHQ16134 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ETFDHQ16134 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ETFDHQ16134 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ETFDHQ16134 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ETFDHQ16134 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ETFDHQ16134 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ETFDHQ16134 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ETFDHQ16134 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ETFDHQ16134 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ETFDHQ16134 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ETFDHQ16134 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ETFDHQ16134 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ETFDHQ16134 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ETFDHQ16134 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ETFDHQ16134 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ETFDHQ16134 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms