Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms