Protein–RNA interactions for Protein: Q15427

SF3B4, Splicing factor 3B subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B4Q15427 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.462e-7■■■■■ 33.1
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SF3B4Q15427 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.282e-7■■■■■ 33.1
SF3B4Q15427 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.212e-7■■■■■ 33.1
SF3B4Q15427 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.122e-7■■■■■ 33.1
SF3B4Q15427 EEF1D-224ENST00000529007 861 ntTSL 215.79■□□□□ 0.122e-7■■■■■ 33.1
SF3B4Q15427 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.052e-7■■■■■ 33.1
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SF3B4Q15427 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.322e-7■■■■■ 33.1
SF3B4Q15427 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.718e-10■■■■■ 33.1
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SF3B4Q15427 SULT1A1-207ENST00000564818 1653 ntTSL 1 (best)17.88■□□□□ 0.458e-10■■■■■ 33.1
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SF3B4Q15427 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.348e-10■■■■■ 33.1
SF3B4Q15427 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.338e-10■■■■■ 33.1
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SF3B4Q15427 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.168e-10■■■■■ 33.1
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SF3B4Q15427 HS6ST1-201ENST00000259241 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.548e-10■■■■■ 33.1
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SF3B4Q15427 SULT1A1-211ENST00000569554 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.738e-10■■■■■ 33.1
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SF3B4Q15427 STX16-203ENST00000358029 4329 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.831e-6■■■■■ 33.1
SF3B4Q15427 STX16-204ENST00000359617 4273 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.851e-6■■■■■ 33.1
SF3B4Q15427 SMARCA4-218ENST00000592158 409 ntTSL 28.12□□□□□ -1.113e-8■■■■■ 33.1
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SF3B4Q15427 MTA1-213ENST00000490198 814 ntTSL 318.67■□□□□ 0.584e-7■■■■■ 33.1
SF3B4Q15427 RPS6KA1-207ENST00000474934 857 ntTSL 414.39□□□□□ -0.114e-7■■■■■ 33.1
SF3B4Q15427 SZT2-216ENST00000639852 1314 ntTSL 511.72□□□□□ -0.534e-7■■■■■ 33.1
SF3B4Q15427 IPO13-202ENST00000372343 3894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.612e-6■■■■■ 33.1
SF3B4Q15427 C2CD5-201ENST00000333957 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.874e-7■■■■■ 33.1
SF3B4Q15427 C2CD5-218ENST00000545552 3471 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.184e-7■■■■■ 33.1
SF3B4Q15427 C2CD5-206ENST00000536386 3496 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.394e-7■■■■■ 33.1
SF3B4Q15427 C2CD5-202ENST00000396028 3463 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.394e-7■■■■■ 33.1
SF3B4Q15427 C2CD5-203ENST00000446597 3490 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.394e-7■■■■■ 33.1
SF3B4Q15427 C2CD5-212ENST00000542676 3438 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.444e-7■■■■■ 33.1
SF3B4Q15427 C2CD5-209ENST00000540245 425 ntTSL 34.93□□□□□ -1.624e-7■■■■■ 33.1
SF3B4Q15427 C2CD5-208ENST00000539615 850 ntTSL 54.74□□□□□ -1.654e-7■■■■■ 33.1
SF3B4Q15427 C2CD5-207ENST00000537643 548 ntTSL 52.3□□□□□ -2.044e-7■■■■■ 33.1
SF3B4Q15427 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.237e-7■■■■■ 33
SF3B4Q15427 FAAP100-203ENST00000443656 3822 ntTSL 1 (best)12.74□□□□□ -0.377e-7■■■■■ 33
SF3B4Q15427 KLHL17-202ENST00000463212 955 ntTSL 1 (best)15.1■□□□□ 0.012e-11■■■■■ 33
SF3B4Q15427 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.095e-7■■■■■ 33
SF3B4Q15427 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.445e-7■■■■■ 33
SF3B4Q15427 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.245e-7■■■■■ 33
SF3B4Q15427 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.325e-7■■■■■ 33
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