Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB3GAP1Q15042 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB3GAP1Q15042 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
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