Protein–RNA interactions for Protein: Q14781

CBX2, Chromobox protein homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX2Q14781 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CBX2Q14781 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CBX2Q14781 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CBX2Q14781 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CBX2Q14781 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CBX2Q14781 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CBX2Q14781 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CBX2Q14781 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CBX2Q14781 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CBX2Q14781 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CBX2Q14781 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CBX2Q14781 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CBX2Q14781 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CBX2Q14781 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CBX2Q14781 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CBX2Q14781 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CBX2Q14781 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CBX2Q14781 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CBX2Q14781 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CBX2Q14781 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CBX2Q14781 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CBX2Q14781 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CBX2Q14781 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CBX2Q14781 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CBX2Q14781 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CBX2Q14781 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CBX2Q14781 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CBX2Q14781 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CBX2Q14781 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CBX2Q14781 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CBX2Q14781 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CBX2Q14781 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CBX2Q14781 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CBX2Q14781 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CBX2Q14781 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CBX2Q14781 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CBX2Q14781 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CBX2Q14781 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CBX2Q14781 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CBX2Q14781 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CBX2Q14781 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CBX2Q14781 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CBX2Q14781 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CBX2Q14781 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CBX2Q14781 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CBX2Q14781 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CBX2Q14781 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CBX2Q14781 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CBX2Q14781 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CBX2Q14781 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CBX2Q14781 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CBX2Q14781 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CBX2Q14781 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CBX2Q14781 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CBX2Q14781 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CBX2Q14781 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CBX2Q14781 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CBX2Q14781 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CBX2Q14781 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CBX2Q14781 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CBX2Q14781 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CBX2Q14781 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CBX2Q14781 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CBX2Q14781 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CBX2Q14781 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CBX2Q14781 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CBX2Q14781 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CBX2Q14781 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CBX2Q14781 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CBX2Q14781 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CBX2Q14781 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CBX2Q14781 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CBX2Q14781 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CBX2Q14781 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CBX2Q14781 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CBX2Q14781 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CBX2Q14781 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CBX2Q14781 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CBX2Q14781 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CBX2Q14781 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CBX2Q14781 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CBX2Q14781 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CBX2Q14781 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CBX2Q14781 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CBX2Q14781 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CBX2Q14781 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CBX2Q14781 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CBX2Q14781 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CBX2Q14781 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CBX2Q14781 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CBX2Q14781 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CBX2Q14781 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CBX2Q14781 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CBX2Q14781 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CBX2Q14781 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CBX2Q14781 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CBX2Q14781 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CBX2Q14781 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CBX2Q14781 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CBX2Q14781 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms