Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HTR4Q13639 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HTR4Q13639 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HTR4Q13639 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HTR4Q13639 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HTR4Q13639 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HTR4Q13639 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HTR4Q13639 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HTR4Q13639 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HTR4Q13639 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HTR4Q13639 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HTR4Q13639 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HTR4Q13639 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HTR4Q13639 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HTR4Q13639 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HTR4Q13639 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HTR4Q13639 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HTR4Q13639 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HTR4Q13639 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HTR4Q13639 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HTR4Q13639 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HTR4Q13639 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HTR4Q13639 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HTR4Q13639 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HTR4Q13639 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HTR4Q13639 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HTR4Q13639 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HTR4Q13639 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HTR4Q13639 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HTR4Q13639 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HTR4Q13639 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HTR4Q13639 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HTR4Q13639 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HTR4Q13639 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HTR4Q13639 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HTR4Q13639 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HTR4Q13639 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HTR4Q13639 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HTR4Q13639 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HTR4Q13639 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HTR4Q13639 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HTR4Q13639 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HTR4Q13639 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HTR4Q13639 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HTR4Q13639 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HTR4Q13639 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HTR4Q13639 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HTR4Q13639 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HTR4Q13639 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HTR4Q13639 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HTR4Q13639 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HTR4Q13639 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
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HTR4Q13639 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
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HTR4Q13639 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
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HTR4Q13639 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HTR4Q13639 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
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HTR4Q13639 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HTR4Q13639 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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