Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
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NAE1Q13564 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NAE1Q13564 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
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NAE1Q13564 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
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NAE1Q13564 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
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NAE1Q13564 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NAE1Q13564 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NAE1Q13564 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NAE1Q13564 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NAE1Q13564 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NAE1Q13564 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NAE1Q13564 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NAE1Q13564 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NAE1Q13564 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NAE1Q13564 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NAE1Q13564 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NAE1Q13564 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NAE1Q13564 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NAE1Q13564 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NAE1Q13564 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NAE1Q13564 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NAE1Q13564 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NAE1Q13564 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NAE1Q13564 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NAE1Q13564 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NAE1Q13564 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NAE1Q13564 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NAE1Q13564 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NAE1Q13564 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NAE1Q13564 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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