Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TCOF1Q13428 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TCOF1Q13428 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TCOF1Q13428 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
TCOF1Q13428 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TCOF1Q13428 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TCOF1Q13428 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TCOF1Q13428 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TCOF1Q13428 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TCOF1Q13428 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TCOF1Q13428 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TCOF1Q13428 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TCOF1Q13428 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TCOF1Q13428 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TCOF1Q13428 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TCOF1Q13428 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TCOF1Q13428 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TCOF1Q13428 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TCOF1Q13428 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TCOF1Q13428 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TCOF1Q13428 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TCOF1Q13428 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TCOF1Q13428 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TCOF1Q13428 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TCOF1Q13428 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TCOF1Q13428 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TCOF1Q13428 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
TCOF1Q13428 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TCOF1Q13428 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TCOF1Q13428 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TCOF1Q13428 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TCOF1Q13428 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TCOF1Q13428 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TCOF1Q13428 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TCOF1Q13428 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TCOF1Q13428 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TCOF1Q13428 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TCOF1Q13428 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
TCOF1Q13428 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TCOF1Q13428 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TCOF1Q13428 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TCOF1Q13428 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TCOF1Q13428 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TCOF1Q13428 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TCOF1Q13428 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TCOF1Q13428 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
TCOF1Q13428 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TCOF1Q13428 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
TCOF1Q13428 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
TCOF1Q13428 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
TCOF1Q13428 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TCOF1Q13428 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TCOF1Q13428 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TCOF1Q13428 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TCOF1Q13428 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TCOF1Q13428 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TCOF1Q13428 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TCOF1Q13428 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TCOF1Q13428 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
TCOF1Q13428 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TCOF1Q13428 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
TCOF1Q13428 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TCOF1Q13428 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TCOF1Q13428 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TCOF1Q13428 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TCOF1Q13428 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TCOF1Q13428 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TCOF1Q13428 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TCOF1Q13428 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TCOF1Q13428 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TCOF1Q13428 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TCOF1Q13428 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TCOF1Q13428 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TCOF1Q13428 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TCOF1Q13428 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TCOF1Q13428 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TCOF1Q13428 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TCOF1Q13428 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TCOF1Q13428 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TCOF1Q13428 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TCOF1Q13428 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TCOF1Q13428 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TCOF1Q13428 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TCOF1Q13428 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TCOF1Q13428 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TCOF1Q13428 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TCOF1Q13428 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TCOF1Q13428 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
TCOF1Q13428 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
TCOF1Q13428 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
TCOF1Q13428 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TCOF1Q13428 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TCOF1Q13428 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TCOF1Q13428 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
TCOF1Q13428 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TCOF1Q13428 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TCOF1Q13428 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TCOF1Q13428 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TCOF1Q13428 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TCOF1Q13428 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
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