Protein–RNA interactions for Protein: Q12769

NUP160, Nuclear pore complex protein Nup160, humanhuman

Predictions only

Length 1,436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP160Q12769 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
NUP160Q12769 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
NUP160Q12769 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
NUP160Q12769 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
NUP160Q12769 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
NUP160Q12769 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
NUP160Q12769 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
NUP160Q12769 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
NUP160Q12769 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
NUP160Q12769 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
NUP160Q12769 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
NUP160Q12769 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
NUP160Q12769 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
NUP160Q12769 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
NUP160Q12769 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
NUP160Q12769 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
NUP160Q12769 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
NUP160Q12769 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
NUP160Q12769 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
NUP160Q12769 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
NUP160Q12769 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
NUP160Q12769 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
NUP160Q12769 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
NUP160Q12769 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
NUP160Q12769 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
NUP160Q12769 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
NUP160Q12769 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
NUP160Q12769 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
NUP160Q12769 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
NUP160Q12769 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
NUP160Q12769 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
NUP160Q12769 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
NUP160Q12769 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
NUP160Q12769 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
NUP160Q12769 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
NUP160Q12769 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
NUP160Q12769 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
NUP160Q12769 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
NUP160Q12769 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC31.58■■■□□ 2.65
NUP160Q12769 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
NUP160Q12769 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
NUP160Q12769 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
NUP160Q12769 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.65
NUP160Q12769 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
NUP160Q12769 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
NUP160Q12769 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
NUP160Q12769 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
NUP160Q12769 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
NUP160Q12769 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
NUP160Q12769 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
NUP160Q12769 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
NUP160Q12769 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
NUP160Q12769 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
NUP160Q12769 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
NUP160Q12769 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
NUP160Q12769 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
NUP160Q12769 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
NUP160Q12769 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
NUP160Q12769 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
NUP160Q12769 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
NUP160Q12769 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
NUP160Q12769 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
NUP160Q12769 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC31.56■■■□□ 2.64
NUP160Q12769 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
NUP160Q12769 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
NUP160Q12769 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
NUP160Q12769 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
NUP160Q12769 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC31.56■■■□□ 2.64
NUP160Q12769 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
NUP160Q12769 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
NUP160Q12769 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
NUP160Q12769 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
NUP160Q12769 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
NUP160Q12769 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
NUP160Q12769 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
NUP160Q12769 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
NUP160Q12769 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
NUP160Q12769 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
NUP160Q12769 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
NUP160Q12769 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
NUP160Q12769 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
NUP160Q12769 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
NUP160Q12769 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
NUP160Q12769 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
NUP160Q12769 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
NUP160Q12769 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
NUP160Q12769 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC31.54■■■□□ 2.64
NUP160Q12769 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
NUP160Q12769 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
NUP160Q12769 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
NUP160Q12769 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
NUP160Q12769 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
NUP160Q12769 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
NUP160Q12769 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
NUP160Q12769 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
NUP160Q12769 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
NUP160Q12769 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
NUP160Q12769 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
NUP160Q12769 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
NUP160Q12769 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms