Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNTN2Q02246 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNTN2Q02246 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms