Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms