Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CLTCQ00610 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CLTCQ00610 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CLTCQ00610 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
CLTCQ00610 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CLTCQ00610 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CLTCQ00610 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CLTCQ00610 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CLTCQ00610 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CLTCQ00610 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CLTCQ00610 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CLTCQ00610 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CLTCQ00610 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CLTCQ00610 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CLTCQ00610 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CLTCQ00610 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CLTCQ00610 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CLTCQ00610 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
CLTCQ00610 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CLTCQ00610 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CLTCQ00610 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CLTCQ00610 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CLTCQ00610 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CLTCQ00610 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CLTCQ00610 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CLTCQ00610 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CLTCQ00610 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CLTCQ00610 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CLTCQ00610 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CLTCQ00610 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CLTCQ00610 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CLTCQ00610 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CLTCQ00610 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CLTCQ00610 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CLTCQ00610 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CLTCQ00610 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CLTCQ00610 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CLTCQ00610 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CLTCQ00610 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CLTCQ00610 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CLTCQ00610 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CLTCQ00610 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CLTCQ00610 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CLTCQ00610 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CLTCQ00610 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CLTCQ00610 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CLTCQ00610 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CLTCQ00610 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CLTCQ00610 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CLTCQ00610 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CLTCQ00610 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CLTCQ00610 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CLTCQ00610 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CLTCQ00610 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CLTCQ00610 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CLTCQ00610 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CLTCQ00610 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CLTCQ00610 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CLTCQ00610 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CLTCQ00610 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CLTCQ00610 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CLTCQ00610 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CLTCQ00610 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CLTCQ00610 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CLTCQ00610 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CLTCQ00610 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CLTCQ00610 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CLTCQ00610 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CLTCQ00610 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CLTCQ00610 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CLTCQ00610 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CLTCQ00610 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CLTCQ00610 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CLTCQ00610 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CLTCQ00610 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CLTCQ00610 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CLTCQ00610 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CLTCQ00610 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CLTCQ00610 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CLTCQ00610 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CLTCQ00610 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CLTCQ00610 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CLTCQ00610 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CLTCQ00610 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.16
CLTCQ00610 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC28.58■■■□□ 2.16
CLTCQ00610 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CLTCQ00610 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CLTCQ00610 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CLTCQ00610 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CLTCQ00610 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CLTCQ00610 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CLTCQ00610 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CLTCQ00610 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CLTCQ00610 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CLTCQ00610 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CLTCQ00610 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CLTCQ00610 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CLTCQ00610 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CLTCQ00610 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CLTCQ00610 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms