Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RPS29P62273 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RPS29P62273 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RPS29P62273 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RPS29P62273 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RPS29P62273 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RPS29P62273 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
RPS29P62273 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RPS29P62273 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RPS29P62273 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RPS29P62273 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RPS29P62273 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RPS29P62273 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RPS29P62273 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RPS29P62273 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RPS29P62273 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RPS29P62273 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RPS29P62273 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RPS29P62273 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
RPS29P62273 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
RPS29P62273 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
RPS29P62273 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
RPS29P62273 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
RPS29P62273 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
RPS29P62273 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
RPS29P62273 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RPS29P62273 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RPS29P62273 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RPS29P62273 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RPS29P62273 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RPS29P62273 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RPS29P62273 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RPS29P62273 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RPS29P62273 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RPS29P62273 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RPS29P62273 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RPS29P62273 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RPS29P62273 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RPS29P62273 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
RPS29P62273 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RPS29P62273 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
RPS29P62273 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
RPS29P62273 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RPS29P62273 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RPS29P62273 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RPS29P62273 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RPS29P62273 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RPS29P62273 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RPS29P62273 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
RPS29P62273 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RPS29P62273 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RPS29P62273 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
RPS29P62273 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RPS29P62273 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RPS29P62273 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RPS29P62273 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RPS29P62273 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RPS29P62273 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RPS29P62273 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RPS29P62273 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RPS29P62273 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RPS29P62273 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RPS29P62273 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RPS29P62273 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RPS29P62273 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RPS29P62273 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RPS29P62273 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RPS29P62273 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RPS29P62273 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RPS29P62273 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RPS29P62273 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RPS29P62273 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RPS29P62273 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RPS29P62273 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RPS29P62273 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RPS29P62273 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RPS29P62273 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RPS29P62273 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RPS29P62273 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RPS29P62273 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RPS29P62273 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RPS29P62273 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RPS29P62273 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RPS29P62273 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RPS29P62273 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
RPS29P62273 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RPS29P62273 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RPS29P62273 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RPS29P62273 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RPS29P62273 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RPS29P62273 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
RPS29P62273 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RPS29P62273 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RPS29P62273 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RPS29P62273 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RPS29P62273 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RPS29P62273 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RPS29P62273 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RPS29P62273 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RPS29P62273 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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