Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms